สถานีพัฒนาที่ดินสมุทรปราการ ได้รับการจัดตั้งขึ้นเมื่อ เดือนเมษายน 2546 ตามพระราชกฤษฎีกา การแบ่งส่วนราชการ ของกรมพัฒนาที่ดิน กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ โดยสถานีพัฒนาที่ดินสมุทรปราการสังกัดสำนักงานพัฒนาที่ดินเขต 1
          สำหรับการปฏิบัติงานสถานีพัฒนาที่ดินสมุทรปราการ มีที่ทำการชั่วคราว ณ เลขที่ 725-726 หมู่ 11 ตำบลคลองด่าน อำเภอบางบ่อ จังหวัดสมุทรปราการ ต่อมาพ.ศ. 2550 ได้รับความอนุเคราะห์พื้นที่สำหรับก่อสร้างอาคารสำนักงาน จากที่ราชพัสดุ จำนวน 31 ไร่ 58 ตารางวา